Bestrijding darmbacterie E. coli dichterbij

E. coli is een darmbacterie die verantwoordelijk is voor onder andere buikvliesontsteking en voedselvergiftiging. Omdat de bacterie zich kan aanpassen aan veranderingen in de omgeving is hij moeilijk te bestrijden. Tijdens recent onderzoek ontdekten Leidse wetenschappers een mogelijk belangrijk aanknopingspunt bij het bestrijden van de bacterie.

Eiwit H-NS zet genen van de bacterie ‘aan’ en ‘uit’

In E. coli zit het eiwit H-NS. Dit eiwit heeft de eigenschap dat het genen van de bacterie aan en uit kan zetten. Omdat deze genen aan en uit kunnen worden gezet, kan de bacterie zich aanpassen als de omgevingsomstandigheden, zoals temperatuur en zoutgehalte, veranderen. Wetenschapper Ramon van der Valk van het Leiden Institue of Chemistry ontdekte hoe dit proces precies werkt. Zijn vergaarde kennis kan de basis vormen voor nieuwe te ontwikkelen antibiotica tegen E. coli en mogelijk andere bacteriën. ‘Al in 2000 ontdekte mijn collega Remus Dame hoe het eiwit H-NS zorgt voor het uit zetten van bepaalde genen in de E. coli-bacterie’, vertelt Van der Valk. ‘Maar hoe vervolgens deze genen weer kunnen worden aangezet, was tot nu toe onbekend.’

Onderzoek naar werking van H-NS

Het onderzoek was een samenwerking tussen de universiteiten van Leiden, Amsterdam en Heidelberg. De wetenschappers gebruikten een multidisciplinaire benadering om de werking van H-NS en de beïnvloeding door de omgeving te onderzoeken. ‘Het onderzoek richtte zich op verschillende omgevingssignalen waarop het eiwit reageert, zoals temperatuur, pH of verandering van de zoutconcentratie. Middels biochemische en biofysische methodes in combinatie met computersimulaties hebben we het effect van deze signalen op H-NS ontleed. Vervolgens waren we in staat om in een reageerbuis de manier van binding van H-NS aan DNA te beïnvloeden’, aldus Van der Valk.

Ook in de Daily van vandaag:
> Wat Nederland kan leren van landen als Rwanda en Bolivia
> Dit is de reden waarom jouw scheten gezond zijn voor je partner